Isdefe mantiene su apoyo a todas las actividades que realiza en el seno del Estado Mayor de la Defensa.
Entre otras, y dentro de los servicios que la organización presta al Mando Conjunto de Ciberdefensa (MCCD), ingenieros de Isdefe pertenecientes al área de Ciberdefensa, apoyan al Mando en la prevención, detección y remediación en redes de comunicaciones, tanto en teletrabajo como en modalidad presencial para aquellas actividades consideradas esenciales.